В статье исследуется проблема становления современного инновационного вуза. Предлагается экономико-математическая модель оценки эффективной деятельности современного вуза как инновационного. Отмечается, что в условиях становления экономики основанной на знаниях, необходимо обеспечить укрепление и развитие российской высшей школы и как ведущего звена системы профессионального образования, определяющего ее качественный уровень, и как важнейшей сферы подготовки специалистов, выполнения научных исследований и разработок, определяющих кадровый и технологический уровень народного хозяйства